Para el Presupuesto 2020, la Secretaría de Hacienda envió la Cámara de Diputados la propuesta de estructura programática, en la cual se pasa de 907 a 881 programas presupuestarios a ser ejercidos por el sector público federal.
Los cambios consistieron en dar de alta a 43 programas nuevos que recibirán recursos a partir del siguiente año, otros 16 fueron dados de alta por resectorización (cambios de Secretarías o de Unidad Responsable), hubo fusión de 12 programas en 5, la escisión en 3, y hubo cambio de nombre en 31 programas.
Destaca la eliminación formal del programa Prospera, insignia en el combate a la pobreza desde el sexenio de Salinas, que ahora pasa al sector educación con el nombre de Becas de Educación Básica para el Bienestar Benito Juárez.